quinta-feira, 5 de novembro de 2020

Aula 9/11 - Conteúdo de Próximas Aulas e Projetos - Recapitulação

link: https://meet.google.com/hnt-dwka-sic


Videos de Hoje: 

https://youtu.be/xwhQX8iwpRk

https://youtu.be/brI35a5hz4U

https://youtu.be/iogjvArM1-4


Pauta:

- Monografia de Vanessa Taconha – Mercado de Trabalho do Biólogo da ESALQ

- Projeto IA-CD-GeP4.0 – 7 Subprojetos. Ver postagem especifica.

- Artigo Premiado Completo. Postagem.

- Recapitulação. Nada de novo na disciplina. Quem quiser evoluir è Cursos Extracurriculares, já em janeiro. Também è Trabalhar no Laboratório de IA e CD para Biologia e Ecologia ou também è Certificação de Profissionais em IA e CD (para alunos de graduação e pós-graduação):

      - Rodar Weka – Primeiro Exemplo – LM Supervisionado para Classificação Ratos que Transmitem Hantavirus

                - Rodar Weka a partir de um arquivo ARFF, fazer download do blog e rodar

              Arquivo para Download (ARFF do Weka)

 

                                     Arquivo para Download (ARFF do Weka):

              Arquivo Ratos-Hantavirus

Autor: Gabriel Sarriés

Uma camada de rede neural

=== Confusion Matrix ===

 

  a     b   <-- classified as

98     2 |  a = 0 por DNA è Ratos que não transmitem

1     99 |  b = 1 por DNA è Ratos que transmitem Hantavirus

Assim na primeira linha da matriz temos os ratos da espécie que não transmite Hantavirus.

Na Segunda linha a espécie de ratos que transmitem H.

Na primeira coluna tem os ratos que foram classificados como que não transmitem H, por medidas cormorais e o algoritmo de IA Reses Neurais.

Assim acertou 98 ratos e errou 2.

Na segunda coluna temos os ratos que foram classificados como que transmitem H, pelas medidas e IA. Assim acerou 99 e errou 1 rato na classificação.

 

Ajustamos o Algoritmo de Redes Neurais, colocamos mais uma camada de neurônios, estamos utilizando Duas Camadas de Neuronios:

=== Confusion Matrix ===

 

  a  b   <-- classified as

 99  1 |  a = 0

  1 99 |  b = 1

Melhorou, errou um a menos nos ratos que não transmitem H.

 

Três camadas de Neurônios

=== Confusion Matrix ===

 

   a   b   <-- classified as

  99   1 |   a = 0

   0 100 |   b = 1

Agora identificamos bem os 100 ratos que transmitem H. Ou seja 100% de Taxa de Acerto.

Concluirmos que o Algoritmo Redes Neurais se comportou melhor (errou menos) na medida em que fomos aumentando as camadas de redes neurais.

Porem corremos o risco de sobre ajustar o algoritmo a os dados de aprendizagem. Temos que ver se esse algoritmo esta “overfitado”

Para fazer essa verificação podemos dividir os dados de nosso banco de dados de aprendizagem em um conjunto de Treinamento (60%) e um conjunto de Teste (40%). Veremos se diminui a taxa de acerto, ou amenta a margem de erro.

Agora veremos a matriz de confução fazendo Split 60 – 40%:

=== Confusion Matrix ===

 

  a  b   <-- classified as

 40  0 |  a = 0 Erro era 1/99*100= 1 %, agora é o%, não sintoma de ovarfiting;

  1 39 |  b = 1 O Erro era 0% e agora é 1/39*100= 2,56% então aumentou o erro para a categoria de ratos que transmitem H. Isso é preocupante, sintoma de sobre ajuste (overfiting)













- Rodar Weka a  partir de arquivo tipo texto que está na Internet (blog):


@RELATION ratos

@ATTRIBUTE Masa REAL

@ATTRIBUTE CCauda REAL

@ATTRIBUTE OExter REAL

@ATTRIBUTE PataPos REAL

@ATTRIBUTE PataAnter REAL

@ATTRIBUTE CorpCab REAL

@ATTRIBUTE Class {0,1}

@DATA      

107.4,91.7,13.11,27,19.4,141,0

107.3,90.79,12.97,24.3,19,141.7,0

107.4,90.79,12.97,26.1,19.2,142.2,0

107.4,90.79,12.96,22.5,20.8,142,0

107.5,90.72,12.97,31.2,15.4,141.8,0

107.85,91.56,13.05,27,20.2,141.4,0

107.75,90.65,12.97,23.7,19.2,141.6,0

107.25,90.72,12.92,21.6,21.4,141.7,0

107.45,90.58,12.97,24.6,22,141.9,0

107.6,91.28,13.03,27.6,20,140.7,0

107.65,91.28,13.03,23.7,23.4,141.8,0

107.55,90.65,12.96,23.1,21,142.2,0

107.6,91.56,12.96,23.7,21.6,141.4,0

107.35,90.79,12.97,23.1,21.8,141.7,0

107.55,90.93,12.97,23.1,21.6,141.8,0

107.25,90.86,12.98,27.9,17,141.6,0

107.3,90.93,13.01,24.6,19.6,141.7,0

107.5,90.93,12.97,27,18,141.9,0

107.6,90.72,12.96,22.2,23,141.5,0

107.35,91.14,12.99,25.8,20,141.9,0

107.5,90.93,12.93,25.2,20,141.4,0

107.8,91.35,13,24.3,20.6,141.6,0

107.65,91.42,13,25.2,21.6,141.5,0

107.85,91.14,13,26.1,20,141.6,0

107.55,90.79,12.99,22.2,21.6,141.1,0

107.65,91.28,13.04,24,22,142.3,0

107.75,91.14,13.01,26.7,19.6,142.4,0

107.55,91.21,13.03,29.4,19,141.9,0

107.55,91,13,22.2,21,141.8,0

107.4,90.79,12.93,24.9,18,142,0

107.6,91.07,12.98,23.7,21.4,141.8,0

107.4,90.79,12.97,25.8,18.2,142.3,0

107.5,91,12.96,23.1,21,140.7,0

107.8,91.28,13.01,25.2,20.6,141,0

107.95,91.28,13,26.7,21.2,141.4,0

107.3,91.14,13.02,28.2,19.4,141.8,0

107.75,91.21,13,25.2,19.4,141.8,0

107.65,90.93,12.94,23.7,20,142,0

107.65,91.21,13.01,25.5,18.6,142.1,0

106.95,91.21,12.9,24.3,19.4,141.3,0

107.2,90.86,12.92,26.7,18.8,142.3,0

107.4,91.07,12.96,26.4,19.8,140.9,0

107.45,90.72,12.94,27.9,18,141.7,0

107.45,91.28,12.97,27,19.6,140.9,0

107.4,90.58,12.91,24.6,20.4,141,0

107.15,90.65,12.94,24.9,20.4,141.8,0

107.4,90.93,12.97,24.9,20.4,141.5,0

107.4,90.93,12.97,21.9,21.8,142,0

107.3,90.79,12.98,23.7,20.6,141.1,0

107.25,90.3,12.96,23.4,19.6,142,0

107.3,90.86,12.94,21.6,20,141.3,0

107.65,91.42,13,28.5,19.4,141.1,0

107.25,91.07,13,23.4,21.8,140.9,0

107.7,91.14,13.02,22.8,21.8,141.6,0

107.25,90.58,12.95,23.7,20,141.4,0

107.6,90.79,12.94,27.6,18.8,142,0

107.85,91,12.94,27.6,20.8,141.2,0

107.5,90.72,12.94,26.4,18,141.1,0

107.55,91.07,12.99,23.7,22,141.3,0

107.55,91,12.98,24.6,20.6,141.4,0

107.55,90.72,12.93,24.9,19.8,141.6,0

107.65,90.79,12.94,22.5,21,141.5,0

107.7,90.86,12.94,24,21.2,141.5,0

107.25,91,12.95,24,21.6,141.4,0

107.5,91,12.98,25.8,21.2,141.5,0

107.6,91.42,13,26.4,21.2,140.8,0

107.3,90.65,12.92,23.1,20.6,141.3,0

107.4,90.79,12.93,27.3,19,141.5,0

107.55,90.72,12.98,25.8,19.6,141.8,0

107.45,91.14,13.02,24,22.4,139.6,0

106.9,90.86,12.95,25.2,22.2,140.9,0

107.6,90.93,12.95,24.6,20.6,141.4,0

107.5,90.72,13.02,26.1,20,141.2,0

107.2,90.93,12.96,22.5,21,141.8,0

107.6,90.93,12.97,21.6,21.2,142.1,0

107.05,90.72,12.93,22.8,21.4,141.7,0

107.45,90.93,13.01,26.4,20,141.2,0

107.3,90.86,12.94,22.2,21.2,141,0

107.6,91.35,12.98,23.7,21.8,140.9,0

107.3,90.93,12.94,23.7,20,141.8,0

107.55,90.79,12.97,25.8,20.6,140.6,0

107.45,90.86,12.96,22.5,20.6,141,0

107.6,90.79,12.91,27,19.4,141.9,0

107.6,91.07,12.99,23.7,21.6,141.3,0

107.7,91.49,13.02,27,22.2,141.2,0

107.55,90.93,12.96,26.7,20.4,141.5,0

107.6,90.93,12.97,26.1,19,141.6,0

107.5,90.72,12.92,25.2,20.4,142.1,0

107.45,91.21,12.99,22.2,22.4,141.5,0

107.5,90.93,12.97,24,21,142,0

107.35,90.79,12.93,25.8,19.2,141.6,0

107.7,91,12.99,25.5,19.4,141.4,0

107.45,90.58,12.95,24.6,19.8,141.5,0

107.25,90.65,12.93,22.2,21.4,141.5,0

107.35,90.72,12.95,24.9,20,142,0

107.8,90.93,12.99,27,19,141.7,0

107.5,91.28,13.03,27.3,20.4,141.1,0

107.2,90.79,12.95,24,20.6,141.2,0

107.55,91,12.98,27.3,20.4,141.5,0

107.35,91,12.94,23.4,20,141.2,0

107.2,91.07,13.03,29.1,23.4,139.8,1

107.45,91.35,13.02,33,23,139.5,1

107.45,91.21,13.01,26.1,23.4,140.2,1

107.5,91.28,13.06,29.7,21.8,140.3,1

107.35,91.14,13.03,35.4,21.8,139.7,1

107.5,91.14,13.02,31.8,21.4,139.9,1

107.65,91.21,13.01,27.9,24.2,140.2,1

107.4,91.07,13.04,29.4,23,139.9,1

107.5,91.14,12.99,30,23.8,139.4,1

107.6,91.42,13.08,31.2,22.4,140.3,1

107.6,91.28,13.03,24,23,139.2,1

107.55,91.35,13.03,31.8,23,140.1,1

107.7,91.49,13.11,29.1,23.6,140.6,1

107.45,91.28,12.99,34.2,22,139.9,1

107.55,91.21,13,31.8,21.6,139.7,1

107.75,91.28,13,24.6,22.4,139.2,1

107.35,91.42,13.01,35.4,21,139.8,1

107.35,91.28,13.01,36.3,20.8,139.9,1

107.4,91.35,13.02,33,22,140,1

107.2,91.14,12.99,30.3,24,139.2,1

107.4,91.21,13.04,30.3,24.2,139.6,1

107.55,91.42,13.03,36.9,20.4,139.6,1

107.65,91.56,13.11,34.8,21.2,140.2,1

107.55,91.49,13.04,31.5,22.4,139.7,1

107.35,91.35,13.05,29.7,20.6,140.1,1

107.45,91,13.03,30.6,22.8,139.6,1

107.5,91.28,13.04,28.2,23.2,140.2,1

107.75,91.49,13.03,30.6,23.6,140,1

107.55,91.14,13.02,30.3,22.6,140.3,1

107.25,91.14,13.06,29.4,24.2,139.9,1

107.15,91.14,13,32.1,21,139.8,1

107.25,91.14,12.98,36.9,22.4,139.2,1

107.45,91.35,13.02,31.8,23,139.9,1

107.3,91.14,13.04,31.5,23.6,139.7,1

107.1,91,13.02,33,22.4,139.5,1

107.4,91.07,13.01,35.7,22.2,139.5,1

107.3,90.86,13.02,32.1,22.2,139.4,1

107.45,91.49,13.03,27.9,22.4,138.3,1

107.3,91.28,13.04,33.9,21.6,139.8,1

107.25,91.35,13.02,35.4,20.4,139.6,1

107.4,91.14,13.03,30,23.8,139.3,1

107.35,91,12.94,30.6,22,139.2,1

107.3,91.14,13.04,33.6,21.4,139.9,1

107.5,91.35,13.04,31.8,22.2,139.9,1

107.25,90.86,12.98,34.2,20,139.3,1

107.45,91.42,13.04,35.7,21,139.8,1

107.5,91.35,13.04,34.2,21.4,139.9,1

107.65,91.42,13.03,27.9,22.6,138.1,1

107.35,91.14,13.01,32.1,22,139.4,1

107.45,90.93,13,29.7,24.6,139.4,1

107.45,91.21,12.99,35.7,21.2,139.8,1

107.3,90.93,12.97,35.7,20.2,139,1

107.3,90.79,12.93,31.2,22,139.3,1

107.25,91.07,13.01,36.3,20.6,139.4,1

107.25,91.21,13,33,23,139.5,1

107.55,91,13.03,34.8,21,139.7,1

107.1,90.79,12.96,30.9,22.8,139.5,1

107.2,91.07,13,33.9,21.4,139.2,1

107.4,91.28,13.06,37.5,20,139.3,1

107.3,91.42,13.01,24.3,24.2,137.9,1

107.8,91.07,12.97,22.2,24.4,138.4,1

107.45,91.35,13.01,29.7,20.4,138.1,1

107.3,91.07,13,34.5,21.2,139.5,1

107.35,91.07,13.02,34.8,21.8,139.1,1

107.15,91.21,13,34.2,21,139.8,1

107.55,91.21,13.06,30.9,24,139.7,1

108.15,91.49,13.04,30,20.2,138.8,1

107.8,91.28,13.01,28.8,22.4,138.6,1

107.4,90.93,12.98,28.8,24,139.6,1

107.45,91,12.99,34.2,21.8,139.7,1

106.95,91.49,13.05,26.1,23,137.8,1

107.1,91.42,13.04,36,20.4,139.6,1

107.4,91.35,13.03,35.4,21,139.4,1

107.4,90.72,13,31.2,23.2,139.2,1

107.4,91.07,13,34.2,21,139.6,1

107.45,91.28,13.02,35.7,21.4,139,1

107.15,91.07,13.01,34.8,21,139.7,1

107.25,91.28,13,29.7,24,139.6,1

107.4,91.35,13.03,30.6,24.2,139.1,1

107.25,91.14,13.04,24.6,23.6,137.8,1

107.5,91.28,13.01,34.2,21.4,139.1,1

107.4,91.42,13.06,24,22.8,138.7,1

107.5,91.35,13.01,33,22.8,139.3,1

107.3,91.35,13.04,30.3,22.8,139.3,1

107.35,91.14,13.01,32.1,22.2,139.5,1

107.35,91.28,13,34.5,21.4,139.4,1

107.25,91.28,13,24,24.4,138.5,1

107.4,91,12.97,34.2,21.2,139.2,1

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                - Rodar Weka a partir de arquivo do Excel

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139,5

1

107,2

91,07

13

33,9

21,4

139,2

1

107,4

91,28

13,06

37,5

20

139,3

1

107,3

91,42

13,01

24,3

24,2

137,9

1

107,8

91,07

12,97

22,2

24,4

138,4

1

107,45

91,35

13,01

29,7

20,4

138,1

1

107,3

91,07

13

34,5

21,2

139,5

1

107,35

91,07

13,02

34,8

21,8

139,1

1

107,15

91,21

13

34,2

21

139,8

1

107,55

91,21

13,06

30,9

24

139,7

1

108,15

91,49

13,04

30

20,2

138,8

1

107,8

91,28

13,01

28,8

22,4

138,6

1

107,4

90,93

12,98

28,8

24

139,6

1

107,45

91

12,99

34,2

21,8

139,7

1

106,95

91,49

13,05

26,1

23

137,8

1

107,1

91,42

13,04

36

20,4

139,6

1

107,4

91,35

13,03

35,4

21

139,4

1

107,4

90,72

13

31,2

23,2

139,2

1

107,4

91,07

13

34,2

21

139,6

1

107,45

91,28

13,02

35,7

21,4

139

1

107,15

91,07

13,01

34,8

21

139,7

1

107,25

91,28

13

29,7

24

139,6

1

107,4

91,35

13,03

30,6

24,2

139,1

1

107,25

91,14

13,04

24,6

23,6

137,8

1

107,5

91,28

13,01

34,2

21,4

139,1

1

107,4

91,42

13,06

24

22,8

138,7

1

107,5

91,35

13,01

33

22,8

139,3

1

107,3

91,35

13,04

30,3

22,8

139,3

1

107,35

91,14

13,01

32,1

22,2

139,5

1

107,35

91,28

13

34,5

21,4

139,4

1

107,25

91,28

13

24

24,4

138,5

1

107,4

91

12,97

34,2

21,2

139,2

1

107,4

90,93

13,02

28,8

23,8

139,4

1

107,3

91,21

13,02

38,1

18,2

139,2

1

107,55

91,14

12,98

30,6

24

139,4

1

107,7

91,35

13,06

26,4

22

138,6

1

107,35

91,21

13,02

32,4

22,2

139,2

1

107,5

91,35

13,03

28,8

22

138,5

1

107,45

91,21

13,05

34,8

21,2

139,8

1

107,5

91,28

13,03

29,7

24,2

139,6

1

107,55

91,21

12,99

30,9

23

139,7

1

107,4

91,21

13,04

31,8

22,2

140

1

107,35

91,49

13,08

33,6

22,4

139,4

1

107,15

90,93

12,99

30,6

23

139,6

1


     

     - Segundo Rodar Weka – Segundo Exemplo – ML Supervisionado para Regressão – Previsão

                 - Rodar Weka a partir de um arquivo ARFF, fazer download do blog e rodar

Área de Cultivo de Grãos 

Soja - Milho - Algodão - Trigo - Aveia







Dados para Rodar no Weka
Arquivo

Autor: Gabriel Sarriés

DBO – Demanda Bioquímica de Oxigênio

ICobV – Índice de Cobertura Vegetal

ICArb – Índice de Cobertura Arbórea

IBCont – Bioindicador de Contaminação (agrotóxicos)

Dis_Pl – Distancia do plantio de grãos.


DBO

ICobV

ICArb

Bcont

Dis_Pl

IBD_A

1,604

89

60

11

9

90

0,385

90

61

10

8,9

91

0,216

91

62

9

9,1

92

0,303

90

59

10

8,8

89

1,961

20

12

81

0,2

20

0,782

21

14

79

0,3

22

0,57

22

15

78

0,25

23

2,187

22

12

77

0,2

24

0,764

59

35

41

6

60

0,273

60

32

40

6,5

61

1,883

64

33

38

5,8

63

0,581

62

32

37

5,6

62

0,18

79

50

21

8,2

80

0,007

80

49

20

7,8

79

2,028

80

48

18

8,2

81

2,431

79

47

21

7,7

78




Arquivo para Weka (.arff)

@RELATION biodiv_Animal

@ATTRIBUTE dbo REAL

@ATTRIBUTE  ICob_V REAL

@ATTRIBUTE ICArb REAL

@ATTRIBUTE BCont REAL

@ATTRIBUTE Dist_Pla REAL

@ATTRIBUTE Ibd_A REAL

@DATA

6.416555198,60,99,99,5,90
1.538176272,61,98,99,6,91
...


 

     - Rodar Exemplos do Excel

                  - Regressão – Biomonitor – Macro Excel

                  - Teste T para Comparar Duas Medias Amostrais – Macro Excel

- Vamos Inventar um Exemplo para Cada Exercício


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