sexta-feira, 27 de setembro de 2024

Exemplo do Fertilizante com Variável Clorofila que não apresenta diferenças pelo Teste de Tukey

 /* 1. Entrada de dados */

/* Simulação aleatoria do Gabriel para Clorofila no Excel */

data PlantGrowth;

    input Fertilizer $ Growth Clorofila;

    datalines;

A 12.3 16

A 11.8 18

B 14.2 19

B 13.9 16

B 14.7 13

C 15.4 17

C 14.9 14

C 16.1 20


/* 2. Realizar a ANOVA */

proc anova data=PlantGrowth;

    class Fertilizer; /* Variável categórica */

    model Growth Clorofila = Fertilizer; /* Crescimento em função do fertilizante */

    means Fertilizer / tukey lines; /* Executa o Teste de Tukey após a ANOVA */

run;


Aula 4/10 Leticia outra IA e Tatiana Conected Papers e Universal Primer


Jéssica dos Reis de Souza Exemplo ANOVA - SAS - GPT

 /* 1. Entrada de dados */

data PlantGrowth;
    input Fertilizer $ Growth;
    datalines;
A 10.5
A 12.3
A 11.8
B 14.2
B 13.9
B 14.7
C 15.4
C 14.9
C 16.1
;
run;

/* 2. Realizar a ANOVA */
proc anova data=PlantGrowth;
    class Fertilizer; /* Variável categórica */
    model Growth = Fertilizer; /* Crescimento em função do fertilizante */
    means Fertilizer / tukey; /* Executa o Teste de Tukey após a ANOVA */
run;


Em sex., 27 de set. de 2024 às 20:16, Jessica dos Reis de Souza <jessica.souza0408@usp.br> escreveu:
Caro professor,
Boa noite!

Segue em anexo a apresentação de slides solicitada na aula do dia 27/09.
--
Cordialmente,

Jéssica dos Reis de Souza
Graduanda em Ciências Biológicas
Escola Superior de Agricultura "Luiz de Queiroz" - ESALQ
Universidade de São Paulo - USP


--
Cordialmente,

Jéssica dos Reis de Souza
Graduanda em Ciências Biológicas
Escola Superior de Agricultura "Luiz de Queiroz" - ESALQ
Universidade de São Paulo - USP


--
Cordialmente,

Jéssica dos Reis de Souza
Graduanda em Ciências Biológicas
Escola Superior de Agricultura "Luiz de Queiroz" - ESALQ
Universidade de São Paulo - USP

ANOVA Tatiana Mesquita - SAS fonte GPT e Universal Primer

exemplo SAS


data plantas;


input Fertilizante $ Altura;


datalines;


A 15


A 16


A 14


A 17


A 15


B 18


B 17


B 19


B 18


B 20


C 13


C 12


C 14


C 13


C 12


;

proc print;

run;




/* Passo 2: Realizar a ANOVA */


proc anova data=plantas;


class Fertilizante;


model Altura = Fertilizante;


means Fertilizante / tukey;


run;



 Para fornecer um exemplo didático de aplicação da ANOVA e do teste de

Tukey no software SAS, vou me basear no uso desses testes para comparar

médias de grupos, como descrito no artigo de Driscoll (1996), onde a ANOVA é

aplicada para verificar diferenças entre médias de tratamentos, seguida pelo

teste de Tukey-Kramer para identificar quais grupos são significativamente

diferentes.


### Exemplo Didático de ANOVA e Teste de Tukey no SAS


Imagine um estudo biológico onde queremos avaliar o efeito de três tipos de

fertilizantes (A, B e C) no crescimento de plantas. Foram realizadas cinco

réplicas para cada tratamento (fertilizante), e as alturas médias das plantas (em

cm) foram medidas após um período de crescimento.


**Objetivo:** Determinar se há diferenças significativas nas médias de

crescimento entre os fertilizantes e, em caso positivo, quais fertilizantes diferem

entre si.


### Dados do exemplo:

- **Fertilizantes (Tratamento)**: A, B, C

- **Alturas das plantas (em cm)**:


- Fertilizante A: 15, 16, 14, 17, 15

- Fertilizante B: 18, 17, 19, 18, 20

- Fertilizante C: 13, 12, 14, 13, 12


### Passos para análise no SAS:


1. **Preparação dos Dados:**

- Vamos inserir os dados no formato adequado para o SAS, onde cada linha

representa uma observação com o tratamento e o valor da altura.


2. **ANOVA**: Realizaremos uma análise de variância para testar se as médias

dos grupos são iguais.


3. **Teste de Tukey**: Se o teste ANOVA indicar diferenças significativas,

aplicaremos o teste de Tukey para comparações múltiplas.


### Código SAS:


```sas

/* Passo 1: Inserir os dados */

data plantas;

input Fertilizante $ Altura;

datalines;

A 15

A 16

A 14

A 17

A 15

B 18

B 17

B 19

B 18

B 20

C 13

C 12

C 14

C 13

C 12

;

run;


/* Passo 2: Realizar a ANOVA */

proc anova data=plantas;

class Fertilizante;

model Altura = Fertilizante;

means Fertilizante / tukey;

run;

```


### Explicação:


1. **Data Step**: Insere os dados no SAS. A variável `Fertilizante` identifica os

tratamentos (A, B, C), e a variável `Altura` contém as alturas das plantas.


2. **PROC ANOVA**: O procedimento ANOVA é chamado para analisar as

diferenças entre as médias de `Altura` para os diferentes níveis de

`Fertilizante`.


3. **Testes de Comparação Múltipla (Tukey)**: A opção `means Fertilizante /

tukey` solicita que o teste de comparações múltiplas de Tukey seja realizado

para determinar quais pares de médias diferem significativamente.


### Interpretação dos Resultados:


- Se o valor de p na saída do **teste F** (ANOVA) for menor que 0,05,

rejeitamos a hipótese nula de que as médias dos grupos são iguais.

- O **teste de Tukey** identificará quais tratamentos (fertilizantes) têm médias

significativamente diferentes entre si.


### Base do Exemplo:

Esse exemplo segue a mesma lógica aplicada em estudos similares sobre

robustez da ANOVA e testes de Tukey-Kramer, como descrito por Driscoll


(1996), que destaca a importância de usar ANOVA para comparar médias de

múltiplos grupos e, quando necessário, o teste de Tukey para identificar

diferenças significativas específicas entre pares de grupos [(Driscoll,

1996)](https://consensus.app/papers/robustness-anova-tukeykramer-tests-

driscoll/2dc2ea9b080d524fa2b7947184/?utm_source=chatgpt).


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Laboratórios de IA CD e RE para Pesquisa e Gestão

 

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  • LIA + no PPGI-EA – Ecologia Aplicada
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  • WhatsApp : 019 988 – 627 - 438

Aula 27/9/2024

Pauta:

- Como selecionar variáveis para entrarem na IA, exemplo no reconhecimento dos ratos que transmitem Hantavírus

- ANOVA e Tukey, Enviar para: 

gasarrie@gmail.com

         - RANOVA

         - Teste de Kramer

         - Outros

- Olhada em exercícios

- LIA+ PPGI

- LIA+ LCE

- LIA+ A. Latina e África

 

ANOVA Gemini Exemplo e Conceito

 ANOVA Gemini Exemplo e Conceito


prompt: 

aula basica de anova e teste de tukey com exemplo simples no sas


Resposta da IA Generativa

Análise de Variância (ANOVA) e Teste de Tukey no SAS: Uma Introdução com Exemplo

O que é ANOVA e Teste de Tukey?

  • ANOVA (Analysis of Variance): É uma técnica estatística utilizada para comparar as médias de três ou mais grupos. Ela determina se existe diferença significativa entre as médias desses grupos.
  • Teste de Tukey: Quando a ANOVA indica que há diferença entre as médias, o teste de Tukey é usado para identificar quais grupos específicos são diferentes entre si. Ele realiza comparações múltiplas, ajustando o nível de significância para controlar a taxa de erro tipo I.

Exemplo Simples no SAS

Cenário: Imagine que queremos comparar a altura média de plantas tratadas com três diferentes fertilizantes (A, B e C).

Dados: Suponha que temos os seguintes dados em um dataset chamado plantas:

PlantaFertilizanteAltura
1A15
2A18
3A16
4B12
5B10
6B14
7C20
8C19
9C22

Código SAS:

SAS
data plantas;
  input planta fertilizante altura;
  datalines;
1 A 15
2 A 18
3 A 16
4 B 12
5 B 10
6 B 14
7 C 20
8 C 19
9 C 22
;
run;

proc glm data=plantas;
  class fertilizante;
  model altura = fertilizante;
  means fertilizante / tukey;
run;

Explicação do Código:

  • data plantas;: Cria um dataset chamado "plantas".
  • input planta fertilizante altura;: Define as variáveis do dataset.
  • datalines;: Inicia a entrada dos dados.
  • proc glm data=plantas;: Inicia a procedure de modelos lineares gerais (GLM).
  • class fertilizante;: Define "fertilizante" como uma variável categórica.
  • model altura = fertilizante;: Especifica o modelo linear, onde a altura é explicada pelo fertilizante.
  • means fertilizante / tukey;: Calcula as médias para cada nível de fertilizante e realiza o teste de Tukey.

Resultados: O procedimento proc glm irá gerar uma saída com os resultados da ANOVA e do teste de Tukey. A tabela de ANOVA mostrará se há diferença significativa entre as médias dos grupos. A tabela do teste de Tukey indicará quais grupos são diferentes entre si.

Interpretação dos Resultados

  • ANOVA: Se o valor-p da ANOVA for menor que o nível de significância (usualmente 0.05), rejeitamos a hipótese nula de que todas as médias são iguais. Isso significa que há evidência de que pelo menos um dos grupos possui média diferente dos outros.
  • Teste de Tukey: As comparações múltiplas do teste de Tukey identificarão quais grupos específicos possuem médias significativamente diferentes. As letras diferentes ao lado das médias indicam grupos que são diferentes entre si.

Considerações Adicionais

  • Pressupostos da ANOVA: A ANOVA assume que os dados são normalmente distribuídos, as variâncias são homogêneas e as observações são independentes. É importante verificar esses pressupostos antes de interpretar os resultados.
  • Outros Testes: Existem outros testes de comparações múltiplas além do teste de Tukey, como o teste de Tukey-Kramer e o teste de Duncan. A escolha do teste depende das características dos dados e do objetivo da análise.
  • Gráficos: É útil visualizar os dados usando gráficos como boxplots para comparar a distribuição das alturas em cada grupo.

Onde Aprender Mais?

  • Documentação do SAS: A documentação oficial do SAS oferece detalhes completos sobre a procedure proc glm e outras procedures relevantes.
  • Tutoriais Online: Existem diversos tutoriais e cursos online que abordam a ANOVA e o teste de Tukey no SAS.
  • Livros de Estatística: Livros sobre estatística experimental e análise de dados fornecem uma base teórica sólida para entender esses conceitos.

Observação: Este é um exemplo básico. Em situações mais complexas, você pode precisar ajustar o modelo, considerar outros fatores e realizar análises mais detalhadas.

Com este exemplo, você tem uma base sólida para começar a utilizar a ANOVA e o teste de Tukey no SAS para analisar seus próprios dados.

Deseja explorar algum outro aspecto da ANOVA ou do teste de Tukey? Por exemplo, podemos discutir:

  • Pressupostos da ANOVA e como verificá-los: Normalidade, homogeneidade de variâncias e independência.
  • Outros tipos de ANOVA: ANOVA fatorial, ANOVA de medidas repetidas.
  • Comparações múltiplas: Teste de Tukey, Tukey-Kramer, Duncan.
  • Interpretação dos resultados: Gráficos, tabelas e relatórios.

sexta-feira, 20 de setembro de 2024

Dinâmica de IA Indutiva Supervisionada para Classificação - Ratos - Weka

 Dinâmica de IA Indutiva Supervisionada para Classificação - Ratos - Weka


Arquivo  Hantavirus/Ratos para download: 

Arquivo Weka - Clicar Aqui


Aula 20/9/2024

 Aula 20/9/2024 


Pauta:

- MLS para Classificação

    - Pesquisa de aplicação na sua área de interesse ou na Biologia como um todo

    - Rodar MLS para Classificação em Weka

- Ver Exercícios

Dinâmica de IA Indutiva Supervisionada para Classificação - Ratos - Weka

  Dinâmica de IA Indutiva Supervisionada para Classificação - Ratos - Weka


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Arquivo Weka - Clicar Aqui


sexta-feira, 13 de setembro de 2024

Exercícios

 Exercícios e Seminário

 

Enviar os exercícios e seminario para o e-mail da disciplina.
E-Mail da Disciplina:

biologia.inteligente.10@gmail.com

 

Colocar no Assunto do e-mail o Nome Completo tipo de exercício (pratico ou teórico) número do exercício ou seminário.

 

Seminário

Escolha um assunto entre os exercícios teóricos e práticos e elabore um seminário com 14 slides, em português, inglês ou espanhol.


Exercícios Praticos

    • Exercício Prático 1 – Crie um exemplo de regressão linear simples, análogo ao de Concentrações de As a Diferentes Distancias da Rodovia Anchieta. Rode no Excel ou Libreoffice Calc e no SAS com Regressão Robusta. Se não conseguir criar o exemplo acompanhe as aulas de resolução de exercícios, quando Gabriel resolverá os exercícios como se fosse um aluno, você terá somente que substituir os sinais de interrogação pelos últimos dígitos de seu RG. Prazo: 9/10/2023
Dados para Importar:

Distan.

As

(m)

(mg/kg)

100

0,98??

200

0,95???

300

0,85

400

0,86

500

0,59

600

0,45

700

0,32

800

0,15

900

0,11

1000

0,09

 



1100

2,99

Outlier

FIM.


Exercício Pratico 2. Regressão Multipla em Excel ou LOffice Calc, SAS (proc reg e robustreg) e Weka. Dead Line 10/9.

 

Exercício Pratico 3. Realizar Cluster Analysis - ML Não Supervisionado para Agrupamentos Multivariados.

Exercício Pratico 4.  Realizar PCA com Biplot. ML Não Supervisando para Redução de Dimensão.

 

          Exercícios Teoricos

- Exercício Teórico 1 – Elabore 7 slides sobre os assuntos:

Qualquer coisa que tenha te interessado. 

Assuntos

- I Artificial

- C de Dados

- Robótica

- Machine learning

Dead Line: 27/9/2024

 

- Exercício Teórico 2 – Elabore 7 slides sobre Sociedade e Gestão 5.0. DL: 4/10

Exercício Teórico 3 – Elabore 7 slides sobre ISO 17.025 e ISO 14.001. DL: 11/10

Exercício Teórico 4 – Elabore 7 slides sobre Lean Canvas. DL: 18/10

 

Exercício Teórico 5 – Elabore 7 slides sobre Lean Startup e BOS (Estratégia do Oceano Azul). DL: 25/10.

Exercício Teórico 6 – Elabore 7 slides sobre Inovação Disruptiva. DL: 25/10.

 



PCA - Biplot - IA I para Redução de Dimenção Utimo tipo de IAI (Machine Learning)

   PCA - Biplot - IA I para Redução de Dimenção

Utimo tipo de IAI (Machine Learning)





data imc_dat;

input cat $ imc corr kcal;

cards;

AT 20.65 53.55 3150.???

SEM 23.1 16.45 2950

SE 25.8 2.55 2650

PR 25.4 2.1 2650

;

proc print;

run;

title "PCA - Biplot - Com Medianas";

/*data imc_dat;

input cat $ imc corr kcal; */

proc prinqual data=imc_dat plots=(MDPref) 

                 /* project onto Prin1 and Prin2 */


              ; /* use COV scaling */

   transform identity(imc corr  kcal);  /* identity transform */

   id cat;

   ods select MDPrefPlot;

run;




Inteligencia Qualitativa

 

Otavio

2025 mestrado na China

(11)970776591

Otavio.cmf@usp.br

PCA - Biplot - IA I para Redução de Dimenção Utimo tipo de IAI (Machine Learning)

   PCA - Biplot - IA I para Redução de Dimenção

Utimo tipo de IAI (Machine Learning)





data imc_dat;

input cat $ imc corr kcal;

cards;

AT 20.65 53.55 3150.???

SEM 23.1 16.45 2950

SE 25.8 2.55 2650

PR 25.4 2.1 2650

;

proc print;

run;

title "PCA - Biplot - Com Medianas";

/*data imc_dat;

input cat $ imc corr kcal; */

proc prinqual data=imc_dat plots=(MDPref) 

                 /* project onto Prin1 and Prin2 */


              ; /* use COV scaling */

   transform identity(imc corr  kcal);  /* identity transform */

   id cat;

   ods select MDPrefPlot;

run;




Aula 13/9/2024

 Pauta:

- Projetos Gabriel

- PCA - Biplot: ML Não Superv. para Redução de Dimenção



Prática Profissionalizante na USP: Um Portal para o Mundo Profissional

 

Prática Profissionalizante na USP: Um Portal para o Mundo Profissional

O que é a Prática Profissionalizante na USP?

A Prática Profissionalizante na Universidade de São Paulo (USP) é um conjunto de atividades que visam qualificar, desenvolver ou aperfeiçoar habilidades próprias de uma profissão. Ela oferece aos estudantes a oportunidade de aplicar os conhecimentos teóricos adquiridos em sala de aula em situações reais de trabalho, proporcionando uma transição mais suave para o mercado profissional.

Por que a Prática Profissionalizante é importante?

  • Desenvolvimento de competências: A prática profissionalizante permite que os estudantes desenvolvam habilidades como:
    • Trabalho em equipe
    • Resolução de problemas
    • Comunicação eficaz
    • Adaptabilidade
    • Liderança
  • Contato com o mercado de trabalho: A interação com profissionais da área e a participação em projetos reais permitem aos estudantes conhecer as demandas do mercado e as tendências da profissão.
  • Ampliação da rede de contatos: A prática profissionalizante proporciona a oportunidade de estabelecer contatos com profissionais da área, o que pode ser fundamental para a construção de uma carreira de sucesso.
  • Complementação da formação: A prática profissionalizante complementa a formação acadêmica, oferecendo aos estudantes a oportunidade de vivenciar diferentes aspectos da profissão.

Quais são os tipos de Prática Profissionalizante na USP?

A USP oferece diversos tipos de prática profissionalizante, como:

  • Estágio: A modalidade mais comum, que consiste na realização de atividades em empresas ou instituições, sob a supervisão de um profissional da área.
  • Monitoria: Atividade em que o estudante auxilia professores em disciplinas, realizando atividades como correção de provas, atendimento a dúvidas e organização de materiais didáticos.
  • Iniciação Científica: Atividade em que o estudante desenvolve um projeto de pesquisa sob a orientação de um professor, podendo resultar em publicações em revistas científicas.
  • Extensão Universitária: Atividades que visam levar o conhecimento da universidade para a comunidade, como projetos sociais, cursos de extensão e consultorias.

Como encontrar oportunidades de Prática Profissionalizante na USP?

Para encontrar oportunidades de prática profissionalizante na USP, você pode:

  • Consultar os sites dos departamentos e institutos: Muitos departamentos e institutos da USP oferecem programas de prática profissionalizante.
  • Procurar os coordenadores de curso: Os coordenadores de curso podem te orientar sobre as oportunidades disponíveis e os procedimentos para participar.
  • Participar de feiras de estágios e eventos de carreiras: Esses eventos são uma ótima oportunidade para conhecer empresas e instituições que oferecem vagas de estágio.
  • Utilizar as plataformas digitais da USP: A USP possui plataformas digitais que reúnem diversas oportunidades de prática profissionalizante.

Onde encontrar mais informações?

Para obter mais informações sobre a prática profissionalizante na USP, você pode consultar os seguintes sites:

Lembre-se: A prática profissionalizante é uma etapa fundamental na formação de qualquer profissional. Aproveite essa oportunidade para desenvolver suas habilidades e construir uma carreira de sucesso!

Deseja saber mais sobre algum tipo específico de prática profissionalizante ou sobre como se inscrever em um programa?

Observação: As informações aqui apresentadas são de caráter geral e podem variar de acordo com o curso e o departamento. Recomenda-se que você consulte as informações específicas do seu curso para obter detalhes sobre as oportunidades de prática profissionalizante disponíveis.

Palavras-chave: prática profissionalizante, USP, estágio, monitoria, iniciação científica, extensão universitária, carreira, desenvolvimento profissional.